的电击波打败。在铃兰大会里，小智在劲敌决战！小智对真司!!里使用皮卡丘与真司的波士可多拉对战。

这成为了一场很好的对战，也在皮卡丘被替换成烈焰猴之前成功削弱它的体力。皮卡丘也在白热化的全面对战！小智对真司!!小智与真司对战的续篇中再次出战，并开始和真司的雪妖女对战。一开始它处于劣势，不过之后它成功使用伏特攻击并打败了雪妖女。这让皮卡丘第一次成功打败真司的宝可梦的同时也让小智处于优势。

而在劲敌对战胜负分晓！小智对真司!!，它与真司的电击魔兽对战，不过因为电击魔兽的特性电气引擎使皮卡丘陷入危机，最后很快就被电击魔兽一招劈瓦打败。在神奥联盟半决赛！达克莱伊登场!!，皮卡丘是小智在大会半决赛里与达克多的对战中最后派出的宝可梦。

皮卡丘尽全力打败达可多的拉帝欧斯。虽然一开始几乎没有一招成功伤害拉帝欧斯，不过皮卡丘之后跳上拉帝欧斯身上并在被甩下之前数次使用十万伏特。在皮卡丘正要着陆时，拉帝欧斯使出一招洁净光芒。皮卡丘使出联合绝招——伏特攻击和铁尾与拉帝欧斯相碰撞，并产生大爆炸，结果皮卡丘和拉帝欧斯同时失去战斗能力，但此时小智的所有宝可梦都已失去战斗能力，因此达克多获胜晋级决赛。宝可梦超级愿望到了合众地区，皮卡丘也时常作为小智道馆赛的主力出现。在前往合众地区！捷克罗姆的身影!!

皮卡丘偶遇捷克罗姆。在小智未察觉的情况下，皮卡丘失去了使用电属性招式的能力。而在与藤藤蛇的对战中才终于察觉，最终对战失败，而被修帝误会比藤藤蛇还要弱。而在艾莉丝与牙牙！，它恢复了它的能力并在小智收服豆豆鸽的对战中被使用。

而在三曜道馆！VS爆香猴、冷水猴、花椰猴!!里，小智在挑战三曜道馆时使用皮卡丘与寇恩的冷水猴对战。尽管它已经尽力了，它还是因为冷水猴快速的速度而连一击都没击中就被打败了。在劲敌对战！强敌轻飘飘！，皮卡丘与已经打败了水水獭和暖暖猪的修帝的咕咕鸽对战。皮卡丘多次被燕返击中，但随后使用伏特攻击打败了修帝的咕咕鸽，也让修帝见识了皮卡丘的电击力量。它之后与已经进化的青藤蛇对战，尽管这次并没有失去电击能力，但皮卡丘最终还是输了。而在泡沫栗鼠有洁癖!?

小智使用皮卡丘与白露的炒炒猪对战。一开始皮卡丘处于劣势，最后它还是使用了伏特攻击逆转情势并获得胜利。在皮卡丘对黑眼鳄对鸭宝宝!!，三只鸭宝宝偷走了小智的帽子和黑眼鳄的黑色眼镜。其中一只鸭宝宝在皮卡丘将要使出十万伏特时往它身上丢了个雨伞，使它无法使出电击招式。

而黑眼鳄与三只鸭宝宝对战时，皮卡丘也加入了对战，并在被鸭宝宝攻击后，开始释放电力并成功学会了电球，将三只鸭宝宝击飞了。不久，皮卡丘开始与黑眼鳄对战。

虽然在对战中黑眼鳄成功进化成了混混鳄，但皮卡丘使用了电球将混混鳄使出的尖石攻击弹回混混鳄身上，再次将其击飞。在飞云道馆赛！纯情之心的虫属性宝可梦对战!!，小智在飞云道馆派出皮卡丘与亚堤的保姆虫对战。在经过一场激烈对战之后，皮卡丘使用了铁尾和电球成功获得了胜利。