昭宗爱猷识理达腊逃到漠北，其子买的里八剌等被俘。

洪武五年（1372年）正月至十一月，朱元璋又对北元进行第二次征伐。

又称岭北之战，此战结果，徐达的主力中路军大败，李文忠的东路军得失相当，仅冯胜的西路军获胜，但因惧怕东察合台汗国的东进，冯胜放弃了甘肃。

第二次北征以失败告终。

洪武十四年（1381年）正月，北元平章乃儿不花等南侵明边境。

朱元璋命魏国公徐达为征虏大将军，信国公汤和为左副将军，颍川侯傅友德为右副将军率军北征。

大军渡过胪朐河，俘虏北元知院李宣及其部众。

八月底，明军北征各部胜利班师。

洪武二十年（1387年）正月，朱元璋命宋国公冯胜为征虏大将军，颍国公傅友德、永昌侯蓝玉为左右副将军，率师20万人北征故元太尉纳哈出。

结果是战胜纳哈出，明得其军民24万余人，羊、马、驴、驼、辎重无数，最后肃清了元朝在辽东的势力。

六月底，傅友德以新得到的辽地汉人军士驻守大宁，冯胜等胜利班师。

辽东从此完全纳入明朝版图。

洪武二十一年（1388年）三月，明朝侦察到天元帝脱古思帖木儿在捕鱼儿海，决定急行军直扑元帝所在。

四月十二日，蓝玉部明军到达捕鱼儿海南岸，探知脱古思帖木儿的营地就在捕鱼儿海东北80余里，于是发动突袭，获包括脱古思帖木儿次子地保奴等64人、太子必里秃妃并公主等119人、吴王朵里只、代王达里麻、平章八兰等2994人，以及北元宝玺、图书、金银印章等等。

洪武二十四年（1391年），捕鱼海之战后，有大批降人居大宁都司，因边将市马，拂其所欲，即叛而去。

洪武二十五年(1392年)三月，以周兴为总兵官，进讨也速迭儿，追至彻彻儿山。这次远征塞北，搜捕残敌，大败之，“弭绝边患”，自是不敢进边牧马者十余年。

除了北伐外，朱元璋亦陆续平定中国其他地区。

在徐达、常遇春北伐的同时，朱元璋派胡美由陆路进入福建，汤和和廖永忠所带的水军从海上进攻福建和广东，降服割据势力陈友定、何真等，接着攻取广西。

洪武二年（1369年），徐达从东面进入山西，击败扩廓帖木儿，年底平定陕西。

洪武四年（1371年），汤和、傅友德等灭明夏，取四川。

洪武十五年（1382年）傅友德、蓝玉等取云南，消灭元梁王把匝剌瓦尔密，降服大理段氏。

洪武二十六年（1393年），明朝确立了对整个河西走廊的统治。

朱元璋在位期间，下令农民归耕，奖励垦荒；大搞移民屯田和军屯；组织各地农民兴修水利；大力提倡种植桑、麻、棉等经济作物和果木作物、他还徙富民，抑豪强；下令解放奴婢；减免赋税，严惩贪官；派人到全国各地丈量土地，清查人口等等。

朱元璋深知灾荒给农民造成的痛苦，即位后常常减免受灾和受战争影响的地区的农民的赋税，或给以救济。

多次在全国范围内实行大型的租税蠲免。

洪武二年是明初第一次大规模地蠲免赋税。

之后的三年、四年、九年，也曾在应天、河南、北平、山东、江西、两浙等地陆续蠲免赋税。

到洪武二十四年统计时天下田土，已达到3，874，746顷。

经过洪武时期的努力，社会生产逐渐恢复和发展，史称洪武之治。

朱元璋还十分爱惜民力，提倡节俭。在朱元璋措施的推动下，农民生产热忱高涨。

明初农业发展迅速，元末农村的残破景象得以改观。

农业生产的恢复发展，促进明代手工业和商业的发展。朱元璋的休养生息政策巩固了新王朝的统治，稳定了农民生活，促进了生产的发展。

洪武十三年（1380年），朱元璋以图谋不轨之名诛杀丞相胡惟庸，屠灭三族，连坐其党羽，株连了一万五千多人。

以后又几兴大狱，使“胡惟庸狱”不断牵连扩大。

到洪武二十三年（1390年），功臣太师李善长等人也以与胡惟庸“交通谋反”被赐死，家属成年者七十余人被杀。

着名儒臣宋濂只因受孙子连累，全家被贬到四川，他也病死于途中。

此案延续了十年之久，前后被株连的几十家王公